氦有两种同位素：氦4和氦3。氦4的原子核有两个质子和两个中子，但氦3的原子核只有两个质子和一个中子。氦3在地球上很少见。氦只占地球大气层的0.0005%；氦3只占氦的0.00014%，剩下的99.9986%是氦4。即使地球大气中的氦3完全分离，也只有4000吨。
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